統計基因體與代謝體學
Statistical Genomics and Metabolomics
學期
109-2
學分
0
學分
當期課號
B574
永久課號
B0165
開課單位
公共衛生研究所
授課教師
楊欣洲
校區
陽明
類別
選修
上課時間表
| 節 | 週一 |
|---|---|
5 13:20–14:10 | 統計基因體與代謝體學 YS107（陽明） 3 節連堂 |
6 14:20–15:10 | |
7 15:30–16:20 |
* 根據陽明交大上課時間表所列
概述
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先修科目
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備註
無備註
教學方式
This course covers modern methods, applications, and analysis tools in statistical genomics and metabolomics. The goal of the course is to learn: (1) What are statistical genomics and metabolomics? (2) How to analyze genomic and metabolomic data.
評分方式
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課程大綱
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週次計畫
| 週次 | 主題 |
|---|---|
| 第 1 週 | |
| 第 2 週 | 228連假 |
| 第 3 週 | 人類基因體、致病基因定位、五個大型人類基因體研究計畫、重組與連鎖、連鎖不平衡、關聯分析 (Introduction to human genome and disease gene mapping, five large-scale human genome projects, recombination and linkage, and linkage disequilibrium and association analysis) |
| 第 4 週 | 全基因體關聯性研究、同核型不平衡分析、以基因和以反應路徑為基礎之關聯性研究(Genome-wide association study, homozygosity disequilibrium analysis, and gene-based and pathway-based analysis) |
| 第 5 週 | 資料品質分析、等位不平衡分析、拷貝數分析(Data quality analysis, allelic imbalance analysis, and copy number analysis) |
| 第 6 週 | 基因表現數量性狀、表觀基因體分析、體學資料整合分析、族群藥物基因體分析(Expression quantitative trait loci, epigenomics analysis, integrative analysis of omics data, and population pharmacogenomic study) |
| 第 7 週 | 清明連假 |
| 第 8 週 | 基因-基因與基因-環境交互作用分析、定序科技、罕見變異分析 (Gene-gene interaction and gene-environment interaction analysis, sequencing technology, and rare variant analysis) |
| 第 9 週 | 新冠病毒基因體分析、代謝體資料分析 (SARS-CoV-2 genomic analysis and metabolomics data analysis) |
| 第 10 週 | |
| 第 11 週 | |
| 第 12 週 | |
| 第 13 週 | |
| 第 14 週 | |
| 第 15 週 | |
| 第 16 週 | |
| 第 17 週 | |
| 第 18 週 |
教科書
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Office Hours
- 地點
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- 時間
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- 聯絡方式
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